Если объект недвижимости использовался в предпринимательской деятельности, то при его реализации физлицо не сможет воспользоваться имущественным вычетом по НДФЛ, даже если на момент продажи имущества физлицо утратило статус индивидуального предпринимателя. Такая позиция выражена в письме Минфина России от 04.05.16 № 03-04-05/25690.
